SMP Muhammadiyah PK Kottabarat merupakan sekolah yang mengembangkan model pendidikan terintegrasi, tentunya dengan mengedepankan pondasi aqidah, ibadah, dan akhlak. Mempraktikan proses pendidikan yang visioner, interaktif, inovatif, dan inspiratif, dan juga mengembangkan proses pendidikan berbasis IT yang tentu saja mengusung pondasi nilai-nilai Al-Islam Kemuhammadiyahan, selain itu SMP Muhammadiyah PK Kottabarat mengembangkan setiap potensi murid dengan program ekstrakurikuler, pembiasaan Tahajud dan Tilawah, serta bimbingan progressif tahsin dan tahfizh al-Qur’an. SMP Muhammadiyah PK Kottabarat hadir sebagai jawaban kebutuhan pendidikan modern yang mampu mengikuti perkembangan global yang cepat dan dinamis.